Kontrol alternatif atau perbaikan metode diidentifikasi setelah analisis sebagai yang terbaik tersedia dalam hal kehandalan, performa dan biaya. Meskipun biaya satu pertimbangan penting, regulasi dan kepatuhan analisis tidak mengharuskan EPA untuk memilih alternatif yang paling murah. Sebagai contoh, ketika memilih atau menyetujui sebuah metode untuk membersihkan tempat Superfund, badan biaya saldo dengan efektivitas jangka panjang metode yang diusulkan dan potensi bahaya yang ditimbulkan oleh situs.