Kondisi kekurangan hormon tiroid yang hadir pada saat lahir. Sekitar 1 di 4000 bayi memiliki kekurangan parah fungsi tiroid, sementara bahkan lebih memiliki derajat ringan atau parsial. Jika tidak diobati untuk beberapa bulan setelah melahirkan, hipotiroidisme kongenital dapat menyebabkan cacat intelektual seperti permanen keterbelakangan mental dan pertumbuhan abnormal. Di Amerika Serikat dan banyak negara lain, Semua bayi yang diuji untuk bawaan hipotiroidisme. Jika pengobatan bermula dalam bulan pertama setelah kelahiran, bayi biasanya berkembang secara normal.

Perawatan biasanya terdiri dari dosis harian hormon tiroid (tiroksin) oleh mulut. Karena pengobatan sederhana, efektif dan murah, hampir semua praktek-praktek maju bayi skrining untuk mendeteksi dan mengobati hipotiroidisme bawaan dalam minggu pertama kehidupan.