Gen homeoboks adalah gen yang mengandung "homeoboxes", dan dapat mengatur ekspresi gen lainnya. Ada gen homeoboks minimal 24, beberapa tapi tidak semua yang juga homeotik dalam efeknya. Secara umum, "homeotik" gen adalah gen yang mengendalikan identitas bagian tubuh. Mereka aktif pada tahap awal perkembangan embrio organisme. Beberapa, tetapi tidak semua, gen adalah gen homeotik homeoboks. "Hox" gen adalah gen homeoboks subkelompok homeotik yang menentukan posisi diferensiasi sel dan pembangunan. Mereka berbaring keluar kepala dengan pola tubuh ekor dalam embrio sangat awal. Gen-gen Hox sangat kuno dan luas dibagi di antara hewan bilateral. Setelah kepala ke ekor pola didirikan, gen homeotik mengarahkan nasib perkembangan kelompok-kelompok tertentu dari sel.